如果大家都是单纯的只通过使用漱口水来清洁口腔，清洁牙齿，那么除去的只是浮在牙齿表面上的食物残渣，而在一些很隐蔽的部位：比如牙缝里的食物残渣和沉积物则不易被掉，残留于牙间隙和牙龈沟或者牙周袋内的仍然会迅速繁殖。有研究证明，一个每３小时就可以繁殖一代，并且有些漱口水里含有的成分比牙膏里的成分还要高，常用漱口水可能会导致口腔菌群失调，从而引发诸如感染等口腔疾病的发生。
另外，有些漱口水可以使牙齿、舌苔着色，甚至可能引起可恢复性味觉消失。而对于刷牙，它的一个主要目的就是除去附在牙齿表面的牙菌斑。这个过程中，关键的是通过牙刷的物理摩擦来进行对牙齿的清洁，而漱口水无法进行这种摩擦，因此效果有限。
使用漱口水时，需要注意以下两点：
1、使用漱口水时，也要刷牙
不论哪种漱口水，都只是辅助保持口腔卫生，都不可以替代刷牙。
2、不要长期使用强力的漱口水
在没有医嘱的情况下，不要长期使用含强力的漱口水。长期使用含的漱口水，并不能减少蛀牙风险、减轻牙龈炎症，反而会造成口腔正常菌群的失调、牙齿变色等不良影响。